Auch wenn die historischen Zeugnisse nicht sehr zahlreich sind, kann man mit Sicherheit sagen, dass an der Stelle wo heute die Kirche aus dem 15. Jahrhundert mit dem sehr viel älteren romanischen Wehrturm steht, die älteste Kirche Deggendorfs stand und der älteste Friedhof von Deggendorf zu finden war.
Die Kirche war ursprünglich dem Hl. Johannes dem Täufer geweiht, später kamen noch die Patrozinien von Johannes dem Evangelisten und dem Hl. Nikolaus hinzu.
Im Jahre 1990 wurde die Kirche außen und 1998 innen renoviert.
Jeden Donnerstag ist um 19 Uhr Messe in der Kirche, sonst ist sie verschlossen.
